FightAIDS@Home
https://www.scripps.edu/fightaidsathome/ ↗FightAIDS@Home 是首个把单一疾病作为使命的志愿计算项目。它最初由斯克里普斯研究所 Arthur Olson 实验室于 2002 年独立启动,2005 年 11 月 21 日加入 IBM 的世界社区网格(World Community Grid),从此一举跻身全球算力规模最大的医学研究项目之一。
项目运行 AutoDock——一款分子对接程序,模拟候选药物分子如何与 HIV 的蛋白酶、整合酶等关键蛋白结合。每个工作单元测试一个化合物与一种蛋白构象的结合情况。项目跨越两个阶段——第一阶段(2005–2015)以及采用更复杂的 BEDAM + AutoDock 联合方法的第二阶段(2015–2018)——志愿者的电脑共完成了数十亿次结合模拟。
项目的科学产出绝非纸上谈兵。2010 年 2 月,FightAIDS@Home 宣布发现了两个与 HIV 蛋白酶此前未被识别的位点结合的化合物,开启了一类潜在的全新抗逆转录病毒药物。2019 年 3 月,发表在 JACS 上的论文描述了一处对 HIV-1 核心组装至关重要的新结合口袋——这一发现来自针对该口袋 20 种构象、对超过 160 万个化合物的筛选。项目首篇同行评审论文发表于 2007 年,此后陆续又发表了多篇。
FightAIDS@Home 随着 World Community Grid 从 IBM 移交至 Krembil 研究所而逐步结束。它作为志愿计算能够实质性服务人类医学的概念验证而载入史册——为后来的 OpenPandemics、Mapping Cancer Markers、Help Cure Muscular Dystrophy,以及 Folding@home 和 SiDock@home 的新冠相关工作打开了大门。